《規劃》提出，“十一五”期，水運建設將形成以水運主通道為骨架，以區域性重要航道為依托，以一般航道為基礎的通江達海的全省內河航道體系；完善港口布局，形成以樞紐港為中心，以區域性重要港口為依托，其他一般港口為基礎的層次分明、功能完善、布局合理的全省港口體系。
具體規劃為：與長江沿線六省二市合力建設長江黃金水道，重點建設九江港、南昌港；建設長江沿線瑞昌港、湖口港和彭澤港，贛江沿線吉安、新干、樟樹、贛州港；開工建設贛江石虎塘航電樞紐；完成贛江南昌至湖口二級航道、樟樹至南昌三級航道、吉安至樟樹五級航道、樟樹至南昌三級航道、吉安至樟樹五級航道，贛江東河南昌經三江口至瓢山四級航道整治，江西省水上搜救中心和鄱陽湖分中心建設。啟動袁河渠化建設工程前期工作。完成信江雙港樞紐工程；信江雙港至褚溪河口三級航道整治等。水運客貨運場站發展納入城市發展規劃。
《規劃》同時提出了實施保障要求，一是深化體制改革，推進交通運輸市場化進程。增加建設投資；著重做好行業管理；建立企業法人治理機制；引入市場競爭機制。二是加強項目前期工作，提高項目決策的科學化、民主化水平。三是多方籌措資金，拓寬交通基礎設施建設融資渠道。大力爭取國家投資和國內外金融組織貸款，發揮各級政府、各類經濟實體和廣大群眾辦交通的積極性，繼續實行各級政府安排配套資金的政策；堅持以市場化手段引進國內外資金，推進投資主體多元化，逐步建立起“國家投資、地方籌資、社會融資、利用外資”和“貸款修路、收費還貸、滾動發展”的多渠道投融資機制。盤活存量，變存量為增量，通過經營權轉讓等方式，籌集更多的建設資金。抓好交通規費和通行費的征收，提高融資能力。四是在積極盤活存量土地、閑置土地依法收回調劑使用的基礎上，對全省重大交通建設項目用地優先供給。五是集中力量支持樞紐港港口、高等級航道及航運樞紐等重大交通項目建設。
據了解，“十五”期，江西省水運發展成績顯著，建成贛江樟樹至南昌段五級航道93公里，南昌至湖口段三級航道156公里，吉安至樟樹段五級航道151公里整治及南昌港集裝箱碼頭等一批水運重點工程，77個內河港站項目竣工投產。全省航道通航總里程達5716公里，比2000年增加179公里。支持配合全省旅游產業發展，新余仙女湖、武寧湖、上猶陡水湖、會昌漢仙巖等重點風景區旅游碼頭相繼建成投產，旅游客運泊位達22個，客運站點8個。
