據上海海關統計，2006年上海口岸農產品出口額計為27．6億美元。其中，向美國出口4．3億美元，增長14．8％，增速提高了14．5％；而此外向日本出口9億美元，增長1．7％，增速回落9．8％；對歐盟出口4．2億美元，增長16％，增速回落5．7％；對歐盟和香港分別出口2億美元和1．4億美元，增長4．5％和11．2％，增速分別回落4．2％和3％。
海關表示，我國是世界第五大農產品出口國，近年來隨著我國農產品國際競爭力不斷增強，農產品出口也取得了長足的發展，但由于國際社會對保護生態環境和食品安全的關注與日俱增，以及發達國家貿易保護主義抬頭，技術性貿易壁壘的制度化趨勢，我國農產品出口的市場準入門檻被不斷提高。2006年1月歐盟實施的新食品法以及5月日本實施的《食品中殘留農業化學品肯定列表制度》都給我國農產品出口貿易提出了嚴峻挑戰。
據介紹，“十一五”期間，農產品被列為我國重點支持的出口商品，并于2006年下半年發布了首個關于農產品出口的五年規劃，為了保持上海口岸農產品出口穩定的發展態勢，不斷提升出口效益，業內人士建議，農產品生產企業應該充分利用出口退稅率調整的契機，發展農產品深加工產業，進一步提高深加工產品在農產品出口中的比重，優化出口產品結構。向規模化、集團化發展，提升抗風險能力；發展自有品牌，開發自主知識產權產品，提高核心競爭力；完善經營管理，在生產、流通及加工環節，推行標準化生產方式，建立質量安全管理體系，盡快與國際接軌，將技術壁壘對我國農產品出口的影響逐步降低。
