全省審計機關抓住“預算執行審計”這條主線，加大了本級預算執行審計力度， 2006年共對193個預算執行單位進行了審計，并向人大提交了審計工作報告，有關部門對存在的問題進行了整改。加強了對關系人民群眾切身利益的專項資金的審計和審計調查，去年開展專項資金項目審計325個，審計資金總額達51億元，主要涉及教育系統財務收支、養老保險基金、再就業資金審計，湟中等8縣農村牧區新型合作醫療基金、玉樹等8縣“雙試點”項目審計調查，國土資源專項資金審計。
2006年，全省審計機關對26家企業進行了審計，查出各類違法違規問題金額802萬元，管理不規范金額4213萬元，損失浪費金額12萬元，提出審計建議80多條。同時，積極開展了效益審計，特別加強了對政府重大投資項目的審計，共開展效益審計項目56個，查出違規問題金額1.28億元；開展了經濟責任審計，共對456名黨政領導干部進行了經濟責任審計，查出違規金額17987萬元，管理不規范金額70650萬元，損失浪費金額387萬元，其中有1人受撤職處分；外資審計不斷深入，目前已經審計利用外資項目11項，協議資金9648.3萬美元，占全省協議資金的48.7%。
