交通部于2006年頒布了《全國沿海港口布局規劃》和《全國內河航道與港口布局規劃》，對“十一五”期間的全國沿海及內河港口的建設與發展進行了規劃。 　　《全國沿海港口布局規劃》相關方案是：根據不同地區的經濟發展狀況及特點、區域內港口現狀及港口間運輸關系和主要貨類運輸的經濟合理性，將全國沿海港口劃分為環渤海、長江三角洲、東南沿海、珠江三角洲和西南沿海5個港口群體，強化群體內綜合性、大型港口的主體作用，形成煤炭、石油、鐵礦石、集裝箱、糧食、商品汽車、陸島滾裝和旅客運輸等8個運輸系統的布局。
　　《全國內河航道與港口布局規劃》旨在：規劃內河高等級航道、主要港口，促進沿江、沿河產業密集區的形成，發揮區域內主要城市的經濟輻射帶動作用；形成由通航千噸級及以上內河船舶的高等級航道為骨干、主要港口為主體的全國內河航道和港口體系，促進運輸船舶大型化、標準化，使內河水運資源得到有效開發利用，內河水運優勢得以充分發揮；到2010年，航道通過能力可在目前基礎上提高約40%；到2020年翻一番，船舶航行條件得到明顯改善，單位運輸成本將比目前明顯降低，經濟和社會效益顯著。
　　沿海主要港口“十一五”發展規劃
　　年 份 深水泊位 總通過能力 集裝箱專業泊位
　　2005 1113個 25億噸 5640萬Teu
　　2010E 1752 46 13600
　　“十一五”總計新增 639 21 7960
　　2008－2010規劃新增 13．5－14 4500－5000
　　“十一五”內河港口及航道布局規劃
　　內河航道布局 形成長江干線、西江航運干線、京杭運河、長江三角洲高等級航道網、珠江三角洲高等級航道網和18條主要干支流高等級航道（簡稱兩橫一縱兩網十八線）的布局。
　　構成我國各主要水系以通航千噸級及以上船舶的航道為骨干的航道網絡，規劃內河高等級航道約1．9萬公里（占全國內河航道里程的15％），其中三級及以上航道1．43萬公里，四級航道0．48萬公里，分別占75％和25％
　　到2010年，內河航道通過能力可在目前（2006年）基礎上提高約40％；到2020年再翻一番
　　內河港口布局 規劃布局的內河高等級航道、主要港口遍及20個省（區、市），連接了50萬以上人口的城市56個，占全國的25％，連接了國家一類口岸27個，占全國的29％。實現了主要資源地與消耗地的有效聯接以及主要江河的干支直達和江海直達運輸。