四川汶川大地震發生后，深圳機場海關迅速貫徹落實海關總署與深圳海關關于做好救災援贈物資通關工作的緊急通知精神,以高度的責任感和使命感布置落實相關工作,確保救災援贈物資在深圳機場口岸的快速通關。5月17日-18日，該關迅速辦理兩批抗震救災捐贈物資通關手續。 　　5月17日22點20分，聯邦快遞中國有限公司深圳分公司向深圳機場海關申報進口抗震救災快件一票，該票物資是由澳門寄往成都市紅十字會的繃帶，膠布、麥維他消化餅一批，共計156公斤。該關高度重視，啟用救災物資通關專用窗口、指派專門人員快速辦理通關手續，于當晚22點35分完成驗放工作。該批物資于18日早上搭乘航班飛往成都機常
　　5月18日上午11時,經聯邦快遞公司承運由新加坡、丹麥運送的海事衛星電話100部、衛星電話SIM卡100張，總價值9.2萬美元的一批抗震救災捐贈物資運抵深圳機場海關并辦理深圳至成都轉關手續。該關特事特辦，指定專人第一時間予以辦理，確保抗震救災物資快速通關。該批物資已乘當晚9時左右航班抵達成都，交由四川省慈善總會。