隨著海峽西岸經濟區建設的不斷推進，對兩岸實現直接、雙向、全面“三通”的要求越來越迫切，其重要性越來越凸顯。實現兩岸直接“三通”，有助于充分發揮臺灣海峽的戰略通道作用，構建服務海峽東西岸，服務中西部以及亞太地區的東南沿海港口群;有助于兩岸獲得更便捷的運輸、更暢通的資金流動和更優化
的資源配置，加速形成“海峽經濟區”，形成承北接南、東拓西聯，與長三角、珠三角對接，從環渤海灣到珠江三角洲整個沿海一線的完整經濟繁榮帶，這將極大提高兩岸經濟發展的競爭力。
今年以來，兩岸關系出現了新的積極變化。這為加強兩岸經濟交流合作，實現直接“三通”創造了良好條件。下一步，交通運輸部將與福建省和有關部門密切協作，抓住機遇，發揮優勢，為兩岸直接“三通”做好準備工作。
第一，繼續穩步推進“小三通”。“小三通”在海峽兩岸經濟文化交流中作用十分突出。要繼續發揮“小三通”品牌優勢，為兩岸人民交往提供優質服務。福建省交通、旅游、文化等部門可與臺灣有關方面繼續溝通協商，探索開辟大陸旅客循“小三通”渠道赴臺旅游或臺灣旅客循“小三通”渠道赴大陸旅游的線路。除貨運直航外，還可以探索將“小三通”延伸為兩岸海上客運直航，發展海峽滾裝業務，推動福建沿海與臺灣本島及金門、馬祖、澎湖間開通客貨滾裝船航線等。
第二，增強海峽西岸港口對周邊經濟的輻射作用。充分發揮具有較豐富深水港建設資源這一優勢，從建設海峽經濟區戰略格局考慮，集約使用深水岸線，搞好分工與協作，集中力量推進主要港口建設，整合港口資源，增大吞吐能力。不斷完善主要港口的集疏運體系，加快推進聯接中西部的高速公路等交通基礎設施建設，大力發展“公鐵海空聯運”。發展相對集中的臨港產業，以項目帶動臨港產業發展。使海峽西岸港口真正發展成為服務海峽西岸經濟區，服務中西部，為臺灣提供中轉服務，面向亞太的門戶港口和中轉基地。
第三，大力發展海峽航運業。大力扶持兩岸間的集裝箱班輪航線、滾裝航線和散雜貨不定期航線，吸引臺資航運企業、物流骨干企業入駐福建，積極培育市場、擴展貨源，為海西和海峽經濟區提供方便、快捷、高效的運輸服務。
第四，積極開展兩岸直接“三通”的前瞻性研究工作。交通運輸部將與福建省共同努力，在深化兩岸經濟交流合作進程中，在建設海峽西岸經濟區發展戰略指導下，抓緊研究兩岸直接“三通”管理機制問題，抓緊研究兩岸綜合運輸體系銜接機制問題，力求高起點、高效率、高標準完成兩岸直接“三通”準備工作。
交通運輸部歷來十分重視并支持福建省推進海峽西岸經濟區建設，積極支持福建在推進兩岸直接“三通”上先行先試。在新形勢下，交通運輸部將一如既往地按照中央統一部署，與相關部門共同努力，推進海峽西岸經濟區建設，推動兩岸直接“三通”早日實現。
龍永圖評述：交通運輸部在兩岸交流上擔負著重要的責任。兩岸的直接“三通”，有利于充分利用臺灣海峽的戰略通道作用，構建服務海峽東西兩岸、中西部以及亞太的東南沿海港口群，這實際上不僅僅是有利于我們中國發展的問題，而且是有利于整個亞太地區發展的問題。所以從這個意義上說，海峽西岸經濟區不僅是面向國內，也是面向世界的經濟區。非常感謝交通運輸部這些年來對海西建設所發揮的重要作用。實際上，中央、國務院各部門對海西建設都作出了巨大貢獻。我們也希望，海峽西岸經濟區能夠得到國家部委更加積極的支持，只有這樣，海西發展戰略才能成為一個全國性的戰略，而不僅僅是福建省的一個戰略。