10月22日，南京海關與廈門海關簽訂《南京海關、廈門海關區域通關改革合作備忘錄》，兩地“屬地申報，口岸驗放”通關業務正式啟動。 
南京、廈門關區分別處于“長三角”和“海峽西岸”經濟圈，隨著我國外向型經濟發展，兩個經濟圈的合作越來越緊密。據統計，2008年南京關區企業在廈門各口岸清關貨物的進出口貿易總額為0.97億美元，2009年1-9月份這個數字已達0.94億美元；2008年廈門關區企業在南京各口岸清關貨物的進出口貿易總額為11.6億美元，2009年1-9月份進出口貿易總額已超過2008年全年，達14.5億美元。此次兩地海關簽訂合作備忘錄，意味著兩關區域通關改革合作邁上新臺階，實現了口岸海關的強強聯合和優勢互補，將最大限度簡化通關手續、提高通關效率、降低企業通關成本、加速物流發展，促進“長三角”和“海峽西岸”兩個經濟區共同繁榮發展。 
參加簽約儀式的南京海關副關長沈曉紅表示：“區域通關改革順應了現代物流的發展規律，降低了企業物流成本，有利于充分使用海關監管資源。目前，南京海關已與全國20個海關簽訂了區域通關合作備忘錄。下一步，南京海關將進一步加強與全國其他海關之間的合作交流，實現資源共享，互利互通，促進外向型經濟的整體聯動發展。”