農業合作是中國-東盟自由貿易區10大重點合作領域之一。2002年，中國與東盟簽署《中國與東盟農業合作諒解備忘錄》，中國與東盟開展了全方位的農業交流與合作。廣西是中國重要的農業省份，資源豐富，區位優越，農業產業化發展前景廣闊。 
　　至2005年7月，廣西已在越南中北部建立了水稻及水果新品種推廣示范點各15個，推廣中國水稻及瓜菜品種共30多個，越南中北部農民已廣泛種植中國水稻及水果新品種。廣西農業專家還在越南和緬甸成功試種了中國的14個雜交玉米品種。2006年9月，自治區農業廳為越南、老撾、緬甸、菲律賓、印度尼西亞等國學員進行了發展中國家甘蔗生產與加工技術培訓。近年來廣西與東盟國家共同舉辦了多次農業會展，既促進了廣西與東盟農業的交流與合作，也促進了雙方會展經濟的增長。僅2006年廣西與東盟國家的農產品貿易總額就達到3.83億美元，占廣西與東盟貿易總額的29.6％，東盟成為廣西第二大農產品貿易伙伴。2006年11月，在第三屆中國-東盟博覽會上，廣西分別與泰國、馬來西亞、印度尼西亞、新加坡等東盟國家簽訂了2.665億美元的農業合作項目。廣西與東盟在農業技術、土地資源、農產品品種、林業、農產品市場等方面都具有互補性，合作發展空間廣闊。
　　進一步推進廣西與東盟農業合作，當前應抓好如下幾個方面。
　　面向東盟市場，加快沿邊農業優勢產業發展
　　近年來，廣西沿邊縣市立足于發揮區位和資源優勢，農業結構調整取得明顯成效，在穩定糧食生產的基礎上，初步形成各自的優勢和特色產業。應在此基礎上，把它做強做優。例如蔗糖，現階段一方面可在提高甘蔗單位產量和品質上下工夫，另一方面在糖的綜合利用和深加工上努力。進一步引導農民發展連片規模經營，使更多的土地經營權集中到種蔗能人手上。建設更多的“噸糖田”，提高甘蔗單位產量和品質。鼓勵制糖企業與區內外科研單位、廠商聯合開展技術攻關，開發生產低聚糖、結晶果糖、營養糖、糖果等多品種產品，提高糖的附加值；搞好蔗渣的綜合利用和糖蜜的綜合開發，開發利用蔗葉、蔗尾，拉長蔗糖的產業鏈。
　　大力發展農產品加工業，提高農產品附加值，延長農業產業鏈
　　目前，廣西邊境農產品加工業發展嚴重滯后，農產品加工率低，農業附加值比較低。例如水果加工業，目前我國水果加工比例僅為10%左右，廣西加工設計能力為15%，實際加工量不到8%，中越邊境地區水果加工能力更低。由于加工業落后，90%以上水果靠銷鮮果，一遇豐年便競相降價銷售，給果農造成巨大的損失。因此，發展農產品加工業是廣西邊境農業乃至縣域經濟發展的現實選擇。隨著農業結構調整的不斷深入以及消費需求的不斷變化，大量的農產品需要加工、保鮮、包裝、儲藏、運銷。目前我區已形成了一些新的產業鏈，但農產品加工增值的潛力還很大。農產品加工業是鄉鎮企業新的增長點，也是鄉鎮企業大有作為的舞臺。因此，根據國家和自治區的相關政策，應鼓勵支持鄉鎮企業特別是農產品加工企業的建設，在用地、辦證、稅收、信貸等方面給予優惠政策，為這些產業創造更好的條件，提供更多的保障。
　　推進實施“走出去”戰略，擴大農產品及相關產品出口
　　農業“走出去”一方面可以充分利用國際國內資源，拓展農業發展空間，有效規避國外貿易技術壁壘，以占有更大的國際市場份額；另一方面，可以轉移大量農村剩余勞動力，開辟農民增收致富的新途徑。東盟10國人均占有耕地、森林、草地和淡水資源均高于我國，土地資源的利用和生物資源的開發還處于初級階段，可利用和開發的資源相當豐富。東盟國家的主要農作物水稻和玉米的產量偏低，廣西先進的農業科技和高產農作物品種普遍受到歡迎，雙方在農業新品種和新技術開發、無公害農業、大棚技術、沼氣能源綜合利用等方面的合作大有可為，甘蔗、木薯、水果、茶葉、桑蠶等經濟作物合作的前景更加廣闊。廣西農業和農村經濟發展需要農業企業加快實施“走出去”戰略，重點應是在東盟推廣應用農業技術和優良品種，開發利用農業資源，提高農產品加工水平，增加農產品附加值。
　　目前是廣西推進與東盟農業合作的最好時機，沿邊各縣市（區）應抓住機遇，先行一步，打出一片新天地。龍州縣和越南下瑯縣在第三屆中國-東盟博覽會期間簽署了合作種植甘蔗協議，雙方計劃用3到5年時間在下瑯縣組織當地農民種植甘蔗1000公頃以上。該縣為下瑯縣提供優良蔗種、化肥、農藥和免費技術指導并保價收購，下瑯縣提供土地、勞動力。2007年3月，11車40噸優良蔗種從龍州駛出國門，投向雙方在下瑯縣瑞華社建立的100畝甘蔗種植示范基地。此舉開創了廣西蔗糖業跨國合作之先河。
　　加強物流服務，進一步擴大農產品進出口貿易
　　憑祥口岸日益成為中國與東盟水果貿易的“黃金通道”。目前，憑祥口岸已經形成了集聚效應，來自全國各省（市、自治區）的各種新鮮水果，如蘋果、梨、柑橘、哈密瓜等大量水果經憑祥口岸走向東盟市場。西藏和新疆貨車的“身影”也在這里出現。2006年12月，中國-東盟自由貿易區憑祥物流園一期工程建成投產，開園不久就引起憑祥口岸邊境貿易的持續升溫。2007年5月，總投資約11.4億元的中國-東盟自由貿易區憑祥物流園項目二、三期工程正式開工。工程全部完工后，憑祥物流園將成為我國規模最大、物流基礎設施最完善的陸路邊境口岸物流園。
　　東興市作為我國進入東盟市場的另一便捷陸路通道，近年來邊貿發展態勢強勁，到2007年為止邊貿累計成交額已突破百億元，強勁的邊貿發展態勢帶旺了源源不斷的物流。輕紡城、建材城、海產品、水果批發等一大批專業市場相繼而生，與物流相關的產業也迅速壯大，目前20多家物流企業集聚東興，初步形成了大市場、大物流、大開放的發展格局。可見，大力發展沿邊物流業可以為大宗農產品出口創造更加有利的條件。