廈門檢驗檢疫局在全國率先探索構建“檢驗檢疫監管區”，并積極參與建設“電子口岸”信息平臺，不僅提高了檢疫效率，還累計為企業減負超過1億元。國家質檢總局表示將向全國推廣廈門這些經驗做法。 
進出口貨物通關效率如何，直接影響到城市港口競爭力和港口經濟的發展。以前，由于信息傳遞滯后、貨物堆放分散，檢驗檢疫人員疲于奔命，企業也飽受貨物周轉緩慢之苦。廈門檢驗檢疫局通過設立“檢驗檢疫監管區”，并利用“電子口岸”網絡平臺與港口、海關、企業信息共享，對貨物進行集中查驗，不僅簡化了流程，還提高了有效監管。廈門檢驗檢疫局東渡辦事處楊立輝介紹說：“我們要查驗的貨，我們發一個指令給碼頭，由碼頭來調柜，貨主、貨代都不用來現場了，我們自己每天定時派人在檢驗檢疫集中監管區進行查驗。” 
廈門廈順鋁箔有限公司報關主管李愛鳳對此深有體會：“減少了人力支出和物力支出，節約80%是有了。同時也加快了我們企業的物流速度。對生產效能也會提高。” 
據測算，這些措施實施兩年多來，累計縮短通關時間50萬小時，為轄區企業減負超過1億元。正在廈門參加“檢驗檢疫系統支持地方口岸物流便利化建設現場會議”的國家質檢總局通關司司長劉德平說，廈門的做法使檢驗檢疫、港口、貨主這三方達到共贏，值得在全國口岸推廣：“我們三家都能夠最大限度的相互配合，提高效率。我們這次會議的主要目的，就是總結和推廣廈門經驗，共同來加快物流便利化。”