一、營業(yè)稅存在部分重復(fù)納稅現(xiàn)象。
    二、物流企業(yè)綜合稅負(fù)相對偏高。
    三、所得稅屬地繳納不符合現(xiàn)代物流業(yè)跨區(qū)域發(fā)展的特點(diǎn)。
    四、整合社會運(yùn)輸資源中很難取得合法運(yùn)輸發(fā)票的問題。
    五、物流企業(yè)自開票納稅人的認(rèn)定與額度管理的問題。
    六、倉儲物流服務(wù)中土地使用稅與物流企業(yè)兼并整合中土地出讓金及營業(yè)稅的問題。
    七、物流業(yè)稅收存在征管困難、稅收漏洞，對政策理解差異問題。
    八、有關(guān)行政管理部門管理費(fèi)加重了物流企業(yè)的經(jīng)營負(fù)擔(dān)。