2009年福建交通集團受到國際金融危機的嚴重沖擊，物流、港口、航運等主業經營十分困難，對此，新組建的福建交通集團領導班子迎難而上，緊緊抓住國務院出臺的物流業調整和振興規劃以及支持福建省加快建設海峽西岸經濟區的若干意見的重大戰略機遇，團結帶領全體干部職工，開源節流，降本增效。 
　　一年來集團整合重組工作有序推進，港口建設穩步開展，海運運力規模迭創新高，物流拓展有效提升，商貿購銷有所創新，場站布局得到完善，對臺合作再次突破，黨的建設和精神文明建設持續深化。企業生產經營逐步穩定，企業經濟效益逐步回升，安全生產安定穩定，較好地完成了全年各項預算指標。2009年企業在經營狀況不理想的情況下，仍然實現營收50.99億元,首次突破50億元大關。